Корпус содержит особую дополнительную информацию о свойствах входящих в него текстов (так называемую разметку, или аннотацию). Наличие разметки — главная характеристика корпуса текстов, которая отличает его от простых коллекций (или «библиотек») текстов.

Богатство и разнообразие разметки обеспечивают научную и учебную ценность корпуса. В настоящее время в НКРЯ используются следующие виды разметки: морфологическая, разметка словообразовательной структуры (морфемного состава), синтаксическая, семантическая, лексико-функциональная, эллиптическая, микросинтаксическая, кореферентная, темпоральная и метаразметка (параметры текстов).